Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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