Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SSPNQ14714 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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