Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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TOP3AQ13472 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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