Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 RSPO2-203ENST00000517939 2487 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 LINC02292-201ENST00000554522 1701 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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