Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3839S4R1W1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3839S4R1W1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3839S4R1W1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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