Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcniQ9Z2V9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcniQ9Z2V9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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