Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms