Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt16Q9Z2K1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms