Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms