Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd4Q9Z2D7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms