Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn6Q9Z262 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms