Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms