Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms