Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms