Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms