Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms