Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog1Q9Z160 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms