Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5Q9Z131 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Sh3bp5Q9Z131 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms