Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms