Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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