Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms