Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms