Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slit3Q9WVB4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms