Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms