Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms