Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms