Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NbnQ9R207 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NbnQ9R207 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NbnQ9R207 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NbnQ9R207 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NbnQ9R207 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NbnQ9R207 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms