Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit2Q9R1B9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slit2Q9R1B9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slit2Q9R1B9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit2Q9R1B9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms