Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms