Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zeb2Q9R0G7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Zeb2Q9R0G7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Zeb2Q9R0G7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zeb2Q9R0G7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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