Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms