Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod2Q9R0B9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms