Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamc3Q9R0B6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamc3Q9R0B6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms