Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp11cQ9QZW0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms