Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rnf4Q9QZS2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rnf4Q9QZS2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnf4Q9QZS2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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