Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp21Q9QZL6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp21Q9QZL6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp21Q9QZL6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp21Q9QZL6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp21Q9QZL6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp21Q9QZL6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms