Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms