Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms