Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms