Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms