Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms