Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms