Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms