Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms