Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim44Q9QXA7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim44Q9QXA7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms