Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms