Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms