Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms