Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc42ep4Q9JM96 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms