Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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